稳定细胞系构建的基本原理是将外源DNA克隆到具有某种抗性的载体上，载体被转染到宿主细胞并整合到宿主染色体中，用载体中所含的抗性标志如新霉素（neomycin）、潮霉素（hygromycin）和嘌呤霉素(puromycin)等进行筛选，从而获得可稳定表达目的蛋白，或者稳定表达沉默特定基因的细胞株。慢病毒几乎可以感染所有种类的细胞，并且在感染后可以整合到目的细胞基因组，进行长时间的稳定表达，因此，慢病毒常用于制备稳定表达/沉默特定基因的单克隆细胞株。